主要为头痛、便秘、腹泻、头晕、疲劳、腹痛、失眠。少见不良反应详见药物说明书。
据国外临床研究报道：1374名成年患者参加了帕洛诺司琼预防由中度或重度致吐化疗引起的恶心、呕吐的临床研究。结果表明，帕洛诺司琼引起不良反应的发生率及严重程度与昂丹司琼或多拉司琼相似
在其它临床研究中，单剂量用帕洛诺司琼0.75mg时（推荐剂量的三倍），两名患者产生严重的便秘：一例为在抑制术后恶心、呕吐研究中，患者口服10μg/kg帕洛诺司琼；另一例为一名健康志愿者在药代动力学研究中，静脉注射0.75mg帕洛诺司琼。
临床研究过程中，化疗的成年患者给予帕洛诺司琼治疗时出现一些发生率较低的不良反应，被认为是治疗相关性的或因果关系不明的，这些不良反应包括：
心血管系统：
发生率1%：间歇性的心动过速、心动过缓、低血压；发生率<1%：高血压、心肌缺血、期外收缩、窦性心动过速、窦性心律失常、室上性期外收缩、QT间期延长。多数病例与帕洛诺司琼的关系不明确。
皮肤：
发生率<1%：过敏性皮炎、出疹。
视力和听力：
发生率<1%：运动病、耳鸣、眼刺激和弱视。
胃肠系统：
发生率1%：腹泻；发生率<1%：消化不良、腹痛、口干、呃逆和（胃肠）胀气。
全身：
发生率1%：体弱；发生率<1%：疲劳、发热、潮热和流感样症状。
肝脏：
发生率<1%：一过性、无症状的AST和/或ALT、胆红素升高。主要发生于高催吐化疗的患者。
代谢：
发生率1%：高钾血症；发生率<1%：电解质紊乱、高血糖、代谢性酸中毒、尿糖、食欲减退和厌食。
骨骼肌肉系统：
发生率<1%：关节痛。
神经系统：
发生率1%：头晕；发生率<1%：困倦，失眠，情绪亢进，感觉异常。
精神系统：
发生率1%：焦虑；发生率<1%：欣快感。
泌尿系统：
发生率<1%：尿潴留。
血管系统：
发生率<1%：静脉变色、静脉扩张。
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